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1.
Arq. bras. med. vet. zootec ; 65(3): 801-808, June 2013. tab
Article in Portuguese | LILACS | ID: lil-679116

ABSTRACT

O objetivo deste trabalho foi desenvolver uma PCR em tempo real (qPCR) para o diagnóstico rápido e sensível da doença de Aujeszky. Os iniciadores amplificaram um fragmento de 123 pares de base do gene codificante da glicoproteína D. A qPCR foi testada em 25 amostras de cérebro de suíno positivas e 85 amostras negativas para DA no isolamento viral e na soroneutralização. A sensibilidade analítica foi calculada com acréscimo de um isolado brasileiro do SuHV-1 titulado em amostras de cérebro de suíno negativas na soroneutralização e na PCR. A técnica apresentou sensibilidade analítica de 10-0,5 TCID50/50µL. A qPCR foi capaz de distinguir reações inespecíficas devido a dímero de oligonucleotídeos iniciadores ou amplificações, além do alvo designado (evitando, assim, os falso-positivos), e de obter resultados rápidos.


The aim of this study was to validate a low-cost real-time PCR for a quick and sensitive diagnosis of the disease. The fluorofore used was a DNA intercalating agent, one of the cheaper detection systems. Primers amplified a 123 base pairs fragment of the gene coding for glycoprotein D. PCR was tested on 25 samples of pig brain positive for AD and 85 samples negative in viral isolation and serum neutralization. The detection limit was calculated on samples of pig brain contaminated with a Brazilian isolate of SuHV-1. The technique had a detection limit of 10-0,5 TCID50/50µL. PCR was able to distinguish nonspecific reactions due to primer dimers (thus avoiding false positives) and get faster results.


Subject(s)
Animals , Diagnosis/methods , Polymerase Chain Reaction , Viruses/immunology , Swine/classification
2.
Arq. bras. med. vet. zootec ; 63(6): 1405-1413, dez. 2011. ilus, tab
Article in Portuguese | LILACS | ID: lil-608963

ABSTRACT

Desenvolveu-se uma PCR multiplex (mPCR) para diagnóstico diferencial de encefalite bovina causada por herpesvírus suíno 1 (SuHV-1), herpesvírus bovino 1 (BoHV-1), herpesvírus bovino 5 (BoHV-5) e herpesvírus ovino 2 (OvHV-2). Os iniciadores foram projetados após alinhamento de sequências disponíveis no banco de genomas (GenBank) e a reação foi padronizada levando-se em consideração a concentração dos reagentes e os tipos diferentes de DNA polimerase. Após determinação da especificidade e sensibilidade, 65 amostras de encéfalo de bovinos com síndrome neurológica foram submetidas à análise. A sensibilidade analítica para detecção de BoHV-1, BoHV-5 e SuHV-1 foi, respectivamente, 10(1,2) TCID50/50µL, 10(1,0) TCID50/50µL, 10(1,3) TCID50/50µL na reação multiplex. Das 65 amostras analisadas, 10 foram positivas para BoHV-5, uma para BoHV-1 e cinco para OvHV-2. A mPCR descrita neste trabalho mostrou-se uma técnica útil para o diagnóstico diferencial de enfermidades relacionadas ao sistema nervoso central de bovinos.


The aim of this study was to develop a multiplex PCR (mPCR) for the differential diagnosis of bovine encephalitis caused by the suid herpesvirus 1 (SuHV-1), bovine herpesvirus 1 (BoHV-1), bovine herpesvirus 5 (BoHV-5) and ovine herpesvirus 2 (OvHV -2). The primers were designed after alignment of sequences available in GenBank and the reaction was developed by taking into account the concentration of reagents and different types of DNA polymerase. After determining the specificity and sensitivity to PCR, 65 brain samples from cattle with neurological syndrome were submitted to the reaction. The analytical sensitivity for detection of BoHV-1, BoHV-5 and SuHV-1 was, respectively, 10(1,2) TCID50/50µL, 10(1,0) TCID50/50µL, 10(1,3) TCID50/50µL. Ten samples were positive for BoHV-5, one for BoHV-1, one for SuHV-1 and five for OvHV-2. The mPCR described here is a useful technique for the differential diagnosis of diseases related to the central nervous system of cattle.

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